Из вредителей и в теплицах, и в открытом грунте перец в большинстве случаев повреждает тля, в теплицах – белокрылка, а в открытом грунте – совки, трипсы, колорадский жук и медведки.
Из заболеваний перец в большинстве случаев мучается от табачной мозаики, бактериальной пятнистости и фитофтороза, малость пореже – от неверной мучнистой росы и заразного увядания, а в теплицах – к тому же от сероватой гнилости (от нее защищает проветривание).
Горьковатый перец от многих заболеваний и вредителей защищает себя сам.
Горячим летом обе разновидности перца могут получать солнечные ожоги, если находятся прямо на солнцепеке либо если на их листья в жару попала вода. Ожоги на плодах смотрятся сначала как просто побледневший участок, а позже это место совершенно белеет и становится малость схожим на бумагу. Защитить плоды от этого можно, подвесив пленку для затенения.